آفلاتوکسین B1 و B2 از جمله انواع اصلی آفلاتوکسین ها هستند. آفلاتوکسین B1 فراوان ترین، سمی ترین و سرطان زاترین نوع است. آفلاتوکسین ها ساختار شیمیایی تقریبا مشابهی دارند، به گونه ای که همگی دارای یک حلقه بی فوران هستند که به کومارین متصل شده است. آفلاتوکسین های گروه B دارای یک حلقه سیکلوپنتانون نیز هستند که به کومارین متصل شده است. نامگذاری این ترکیبات به گروه B به این دلیل است که با جذب نور فرابنفش، فلورسانس آبی از خود منتشر می کنند.